超聲檢查甲狀腺的最佳探頭頻率，需根據甲狀腺的疾病進行具體分析。超聲探頭的頻率取決于甲狀腺疾病的類型，如甲狀腺結節、甲狀腺膿腫、甲狀腺癌等。

1、甲狀腺結節：對于良性的甲狀腺結節，如常見的甲狀腺乳頭狀瘤等，通常建議頻率為每周3-4次，且每次探頭需放置在距離甲狀腺結節旁邊1cm以內。如果超聲提示甲狀腺結節為惡性結節，如甲狀腺癌，且為較大的結節，這時為保證腫瘤探測的一致性，也可以選擇少量多次的超聲探頭探查，以免遺漏較小的結節;

2、甲狀腺膿腫：對于甲狀腺膿腫的患者，通常需要經常做超聲檢查，以觀察膿腫壁的變化。如果膿腫壁表現為高回聲、邊界不清、膿腫壁厚度>2.5mm等，則可以診斷為甲狀腺膿腫。對于甲狀腺膿腫患者而言，一般應采取積極的抗感染治療，當炎癥得到控制后，超聲檢查時可以顯示膿腫壁消失;

3、甲狀腺癌：如果患者存在甲狀腺癌，則建議選擇超聲頻率為每周1次。當超聲檢查發現甲狀腺存在結節、腫塊時，應根據結節的大小、形態、邊界、縱橫比等方面，在專業醫生的指導下選擇是否進行穿刺活檢或手術切除，并且建議一旦明確診斷為惡性腫瘤，應及時進行手術治療。

除上述常見情況外，如果存在甲狀腺功能亢進癥等情況，通常也建議選擇每周3次超聲檢查，頻率一般較高。因此，超聲檢查甲狀腺的最佳探頭頻率，需根據具體疾病類型決定。此外，對于超聲檢查發現甲狀腺存在異常的患者，應及時進行血常規、CT、核磁共振等檢查進一步明確診斷，并且及時治療。