囊腫是一種良性的病變，超聲檢查可以通過回聲均勻、囊內呈均勻的高回聲、邊界清晰的特點，以及囊腫的大小、形態、位置等，來判斷囊腫的性質。

1、回聲均勻：超聲檢查時，如果囊腫呈單房性，或者多房性，通常為良性病變，因為單房性的囊腫和多房性的囊腫，多數情況下都為良性病變;

2、囊內呈均勻的高回聲：常見為肝囊腫，如果囊內呈均勻的高回聲，多考慮為良性的病變。此外，腎囊腫、卵巢囊腫等也可能會呈現出此類情況;

3、邊界清晰：超聲檢查可以通過測量囊腫的邊界，或根據囊腫與周圍臟器的關系，判斷囊腫是否存在邊界清晰、形態不規則的特點，以幫助判斷囊腫的性質;

4、囊腫大小：根據超聲檢查結果，判斷囊腫是否存在大小不等的情況。如果囊腫較小，一般為小于5cm的情況，如果囊腫較大，可能會大于5cm。但是單純性囊腫較小，并不一定是良性病變;

5、形態、位置：部分腎臟囊腫可見于腎盂積水，如果腎盂積水較明顯，超聲檢查時可見腎盂擴張且不規則。此外，卵巢巧克力囊腫一般位置在右側卵巢，可能表現為右側卵巢出現比較大的巧克力囊腫。

除此之外，超聲檢查還可以觀察到囊腫內是否有血流信號，以及與周圍組織的關系。但超聲檢查存在一定局限性，不能明確囊腫的性質，需要結合臨床表現以及其它檢查進行綜合判斷。