直腸超聲檢查和腸鏡檢查均為消化道內鏡檢查，二者主要的區別在于檢查原理不同、側重點不同、檢查范圍不同、清晰度不同、價格不同等方面，建議在醫生指導下進行選擇。

1、檢查原理不同：直腸超聲檢查是利用腔內超聲，通過收集腔內二維超聲圖像，通過計算機處理技術，形成可視圖像，從而觀察腸道病變;腸鏡是利用腸鏡本身帶有攝像頭，從肛門處進入體內，能夠清晰地觀察到腸道病變;

2、側重點不同：直腸超聲檢查可通過將病變的組織成像于顯示器上，觀察腸壁的局部病變;腸鏡是從肛門處進入體內，能夠全面觀察到腸道的病變情況;

3、檢查范圍不同：直腸超聲檢查只對直腸病變進行檢查，可以明確病變的范圍，還可以對前端的直腸進行相應的檢查;而腸鏡檢查除了可以清晰地觀察腸壁、腸腔外的病變情況外，還可以在腸鏡下取活檢進行病理學檢查;

4、清晰度不同：由于直腸超聲檢查的過程中沒有放大和縮小，所以對直腸和局部的黏膜也可以進行清晰度檢查;而腸鏡是可以將整個結直腸都放大，從而呈現于顯示器上清晰地觀察結直腸的病變情況;

5、價格不同：由于直腸超聲檢查和腸鏡檢查的價格存在差異，所以檢查費用也有所不同。以直腸超聲檢查為例，一般情況下直腸的價格大概在400-500元;如果做直腸鏡，因為需要使用藥物麻醉，所以還需要具體收費標準，通常需要1000元以上。